Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIMK2P53671 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIMK2P53671 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIMK2P53671 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms