Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCNN1BP51168 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCNN1BP51168 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCNN1BP51168 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms