Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PXNP49023 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PXNP49023 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PXNP49023 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PXNP49023 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PXNP49023 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PXNP49023 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PXNP49023 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PXNP49023 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PXNP49023 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PXNP49023 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PXNP49023 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PXNP49023 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PXNP49023 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PXNP49023 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PXNP49023 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PXNP49023 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PXNP49023 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PXNP49023 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PXNP49023 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PXNP49023 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PXNP49023 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PXNP49023 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PXNP49023 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PXNP49023 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PXNP49023 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PXNP49023 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PXNP49023 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PXNP49023 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PXNP49023 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PXNP49023 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PXNP49023 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PXNP49023 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PXNP49023 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PXNP49023 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PXNP49023 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PXNP49023 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PXNP49023 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PXNP49023 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PXNP49023 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PXNP49023 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PXNP49023 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PXNP49023 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PXNP49023 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PXNP49023 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PXNP49023 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PXNP49023 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PXNP49023 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PXNP49023 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PXNP49023 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PXNP49023 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PXNP49023 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PXNP49023 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PXNP49023 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PXNP49023 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXNP49023 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXNP49023 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PXNP49023 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXNP49023 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXNP49023 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXNP49023 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXNP49023 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PXNP49023 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PXNP49023 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PXNP49023 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PXNP49023 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PXNP49023 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PXNP49023 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PXNP49023 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PXNP49023 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PXNP49023 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PXNP49023 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PXNP49023 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PXNP49023 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PXNP49023 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PXNP49023 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PXNP49023 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PXNP49023 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PXNP49023 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PXNP49023 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PXNP49023 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PXNP49023 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PXNP49023 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PXNP49023 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PXNP49023 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PXNP49023 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PXNP49023 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PXNP49023 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PXNP49023 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PXNP49023 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PXNP49023 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PXNP49023 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PXNP49023 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PXNP49023 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PXNP49023 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PXNP49023 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PXNP49023 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PXNP49023 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PXNP49023 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PXNP49023 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms