Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEDD4P46934 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEDD4P46934 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEDD4P46934 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEDD4P46934 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEDD4P46934 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEDD4P46934 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEDD4P46934 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEDD4P46934 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEDD4P46934 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEDD4P46934 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEDD4P46934 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEDD4P46934 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEDD4P46934 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEDD4P46934 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEDD4P46934 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEDD4P46934 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEDD4P46934 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEDD4P46934 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEDD4P46934 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEDD4P46934 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEDD4P46934 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEDD4P46934 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.33
NEDD4P46934 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEDD4P46934 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEDD4P46934 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NEDD4P46934 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
NEDD4P46934 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
NEDD4P46934 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NEDD4P46934 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NEDD4P46934 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEDD4P46934 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEDD4P46934 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEDD4P46934 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NEDD4P46934 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEDD4P46934 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NEDD4P46934 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEDD4P46934 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEDD4P46934 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NEDD4P46934 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEDD4P46934 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEDD4P46934 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEDD4P46934 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms