Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIA2P42262 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIA2P42262 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIA2P42262 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIA2P42262 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms