Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 TOP3YLR234W 1971 nt9.09□□□□□ -0.95
YRF1-2P40105 HBS1YKR084C 1836 nt9.08□□□□□ -0.96
YRF1-2P40105 YKL102CYKL102C 306 nt9.08□□□□□ -0.96
YRF1-2P40105 PET117YER058W 324 nt9.07□□□□□ -0.96
YRF1-2P40105 RNH201YNL072W 924 nt9.07□□□□□ -0.96
YRF1-2P40105 RPS28AYOR167C 204 nt9.07□□□□□ -0.96
YRF1-2P40105 GCG1YER163C 699 nt9.06□□□□□ -0.96
YRF1-2P40105 SNA3YJL151C 402 nt9.06□□□□□ -0.96
YRF1-2P40105 NTG2YOL043C 1143 nt9.06□□□□□ -0.96
YRF1-2P40105 DUR3YHL016C 2208 nt9.05□□□□□ -0.96
YRF1-2P40105 LIP5YOR196C 1245 nt9.05□□□□□ -0.96
YRF1-2P40105 YBR113WYBR113W 483 nt9.05□□□□□ -0.96
YRF1-2P40105 ERG24YNL280C 1317 nt9.05□□□□□ -0.96
YRF1-2P40105 YDR187CYDR187C 519 nt9.04□□□□□ -0.96
YRF1-2P40105 HNM1YGL077C 1692 nt9.04□□□□□ -0.96
YRF1-2P40105 SAL1YNL083W 1485 nt9.03□□□□□ -0.96
YRF1-2P40105 RAD59YDL059C 717 nt9.02□□□□□ -0.97
YRF1-2P40105 PMT1YDL095W 2454 nt9.01□□□□□ -0.97
YRF1-2P40105 EMP65YER140W 1671 nt9□□□□□ -0.97
YRF1-2P40105 TPI1YDR050C 747 nt9□□□□□ -0.97
YRF1-2P40105 BRN1YBL097W 2265 nt9□□□□□ -0.97
YRF1-2P40105 DUS3YLR401C 2007 nt8.99□□□□□ -0.97
YRF1-2P40105 ALD5YER073W 1563 nt8.99□□□□□ -0.97
YRF1-2P40105 TDH2YJR009C 999 nt8.99□□□□□ -0.97
YRF1-2P40105 ADE16YLR028C 1776 nt8.99□□□□□ -0.97
YRF1-2P40105 RDR1YOR380W 1641 nt8.99□□□□□ -0.97
YRF1-2P40105 URA8YJR103W 1737 nt8.99□□□□□ -0.97
YRF1-2P40105 AFG3YER017C 2286 nt8.98□□□□□ -0.97
YRF1-2P40105 TSR2YLR435W 618 nt8.98□□□□□ -0.97
YRF1-2P40105 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt8.97□□□□□ -0.97
YRF1-2P40105 UIP4YPL186C 915 nt8.97□□□□□ -0.97
YRF1-2P40105 HXK1YFR053C 1458 nt8.97□□□□□ -0.97
YRF1-2P40105 YNR005CYNR005C 405 nt8.96□□□□□ -0.98
YRF1-2P40105 YLL058WYLL058W 1728 nt8.96□□□□□ -0.98
YRF1-2P40105 FMO1YHR176W 1299 nt8.95□□□□□ -0.98
YRF1-2P40105 NUP49YGL172W 1419 nt8.95□□□□□ -0.98
YRF1-2P40105 PGI1YBR196C 1665 nt8.93□□□□□ -0.98
YRF1-2P40105 MSS51YLR203C 1311 nt8.92□□□□□ -0.98
YRF1-2P40105 ZWF1YNL241C 1518 nt8.92□□□□□ -0.98
YRF1-2P40105 RTC2YBR147W 891 nt8.91□□□□□ -0.98
YRF1-2P40105 YHL018WYHL018W 363 nt8.91□□□□□ -0.98
YRF1-2P40105 SEN34YAR008W 828 nt8.91□□□□□ -0.98
YRF1-2P40105 MAM3YOL060C 2121 nt8.91□□□□□ -0.98
YRF1-2P40105 BEM1YBR200W 1656 nt8.91□□□□□ -0.98
YRF1-2P40105 MSC3YLR219W 2187 nt8.9□□□□□ -0.98
YRF1-2P40105 RPL43AYPR043W 279 nt8.89□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 YOL099CYOL099C 492 nt8.88□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 TAE1YBR261C 699 nt8.88□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 MEX67YPL169C 1800 nt8.88□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 GPA2YER020W 1350 nt8.88□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 LYS21YDL131W 1323 nt8.88□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 HSV2YGR223C 1347 nt8.88□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 PFS2YNL317W 1398 nt8.87□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 VMA3YEL027W 483 nt8.87□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 YLL056CYLL056C 897 nt8.87□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 HPT1YDR399W 666 nt8.86□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 CSL4YNL232W 879 nt8.86□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 CDC7YDL017W 1524 nt8.86□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 IVY1YDR229W 1362 nt8.86□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 YBL113CYBL113C 2379 nt8.86□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 YDR327WYDR327W 327 nt8.85□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 RUP1YOR138C 2016 nt8.85□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 NAS6YGR232W 687 nt8.85□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 EGD2YHR193C 525 nt8.85□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 TIF2YJL138C 1188 nt8.85□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 MOG1YJR074W 657 nt8.85□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 TIF1YKR059W 1188 nt8.85□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 SNF7YLR025W 723 nt8.85□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 ERR1YOR393W 1314 nt8.84□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 ERR2YPL281C 1314 nt8.84□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 DON1YDR273W 1098 nt8.84□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 OM45YIL136W 1182 nt8.84□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 ERG27YLR100W 1044 nt8.84□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt8.84□□□□□ -0.99
YRF1-2P40105 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt8.83□□□□□ -1
YRF1-2P40105 CUE4YML101C 354 nt8.83□□□□□ -1
YRF1-2P40105 MRPL10YNL284C 969 nt8.83□□□□□ -1
YRF1-2P40105 GTS1YGL181W 1191 nt8.82□□□□□ -1
YRF1-2P40105 RSC9YML127W 1746 nt8.81□□□□□ -1
YRF1-2P40105 ELA1YNL230C 1140 nt8.81□□□□□ -1
YRF1-2P40105 SGF73YGL066W 1974 nt8.81□□□□□ -1
YRF1-2P40105 HMG2YLR450W 3138 nt8.8□□□□□ -1
YRF1-2P40105 YGL102CYGL102C 429 nt8.8□□□□□ -1
YRF1-2P40105 YGL260WYGL260W 231 nt8.8□□□□□ -1
YRF1-2P40105 PEX3YDR329C 1326 nt8.8□□□□□ -1
YRF1-2P40105 ICP55YER078C 1536 nt8.8□□□□□ -1
YRF1-2P40105 THR1YHR025W 1074 nt8.79□□□□□ -1
YRF1-2P40105 SFP1YLR403W 2052 nt8.79□□□□□ -1
YRF1-2P40105 REC107YJR021C 945 nt8.78□□□□□ -1
YRF1-2P40105 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt8.78□□□□□ -1
YRF1-2P40105 SMX3YPR182W 261 nt8.78□□□□□ -1
YRF1-2P40105 PMT7YDR307W 1989 nt8.77□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 HED1YDR014W-A 489 nt8.77□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 MDL2YPL270W 2322 nt8.77□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 TCB1YOR086C 3561 nt8.76□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 FRA1YLL029W 2250 nt8.75□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 SUR7YML052W 909 nt8.75□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 YMR279CYMR279C 1623 nt8.75□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 PTC7YHR076W 1032 nt8.75□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 ERP5YHR110W 639 nt8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 84.7 ms