Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MMP12P39900 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP12P39900 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP12P39900 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP12P39900 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP12P39900 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP12P39900 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP12P39900 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP12P39900 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP12P39900 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP12P39900 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP12P39900 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP12P39900 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP12P39900 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP12P39900 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP12P39900 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP12P39900 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP12P39900 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP12P39900 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP12P39900 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP12P39900 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP12P39900 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP12P39900 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP12P39900 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP12P39900 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP12P39900 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP12P39900 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP12P39900 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP12P39900 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP12P39900 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP12P39900 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP12P39900 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP12P39900 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP12P39900 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP12P39900 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP12P39900 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP12P39900 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP12P39900 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP12P39900 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP12P39900 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP12P39900 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP12P39900 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MMP12P39900 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MMP12P39900 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP12P39900 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP12P39900 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP12P39900 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP12P39900 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP12P39900 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP12P39900 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP12P39900 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP12P39900 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP12P39900 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP12P39900 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP12P39900 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP12P39900 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP12P39900 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP12P39900 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP12P39900 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP12P39900 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP12P39900 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP12P39900 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP12P39900 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP12P39900 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP12P39900 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP12P39900 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP12P39900 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP12P39900 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP12P39900 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP12P39900 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP12P39900 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP12P39900 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP12P39900 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP12P39900 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP12P39900 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP12P39900 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP12P39900 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP12P39900 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP12P39900 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP12P39900 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP12P39900 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP12P39900 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP12P39900 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP12P39900 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP12P39900 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP12P39900 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP12P39900 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP12P39900 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP12P39900 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP12P39900 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP12P39900 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP12P39900 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP12P39900 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP12P39900 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP12P39900 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP12P39900 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP12P39900 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP12P39900 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP12P39900 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP12P39900 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms