Protein–RNA interactions for Protein: P35625

TIMP3, Metalloproteinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP3P35625 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TIMP3P35625 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP3P35625 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP3P35625 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms