Protein–RNA interactions for Protein: P35442

THBS2, Thrombospondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS2P35442 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THBS2P35442 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THBS2P35442 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THBS2P35442 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THBS2P35442 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THBS2P35442 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THBS2P35442 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THBS2P35442 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THBS2P35442 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THBS2P35442 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THBS2P35442 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THBS2P35442 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THBS2P35442 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THBS2P35442 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THBS2P35442 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THBS2P35442 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THBS2P35442 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THBS2P35442 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THBS2P35442 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THBS2P35442 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
THBS2P35442 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THBS2P35442 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THBS2P35442 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THBS2P35442 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THBS2P35442 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THBS2P35442 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THBS2P35442 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THBS2P35442 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THBS2P35442 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
THBS2P35442 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
THBS2P35442 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THBS2P35442 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THBS2P35442 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THBS2P35442 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THBS2P35442 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THBS2P35442 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THBS2P35442 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THBS2P35442 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THBS2P35442 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THBS2P35442 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THBS2P35442 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THBS2P35442 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THBS2P35442 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THBS2P35442 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THBS2P35442 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THBS2P35442 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THBS2P35442 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THBS2P35442 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THBS2P35442 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THBS2P35442 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THBS2P35442 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THBS2P35442 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THBS2P35442 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THBS2P35442 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
THBS2P35442 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THBS2P35442 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THBS2P35442 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
THBS2P35442 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THBS2P35442 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THBS2P35442 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
THBS2P35442 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THBS2P35442 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THBS2P35442 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THBS2P35442 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THBS2P35442 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
THBS2P35442 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
THBS2P35442 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
THBS2P35442 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THBS2P35442 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THBS2P35442 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THBS2P35442 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
THBS2P35442 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THBS2P35442 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THBS2P35442 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THBS2P35442 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
THBS2P35442 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THBS2P35442 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THBS2P35442 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THBS2P35442 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THBS2P35442 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THBS2P35442 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THBS2P35442 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THBS2P35442 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THBS2P35442 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THBS2P35442 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THBS2P35442 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THBS2P35442 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THBS2P35442 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THBS2P35442 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THBS2P35442 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THBS2P35442 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THBS2P35442 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THBS2P35442 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THBS2P35442 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THBS2P35442 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THBS2P35442 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THBS2P35442 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THBS2P35442 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THBS2P35442 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THBS2P35442 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms