Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFTPDP35247 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFTPDP35247 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms