Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC1P35052 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC1P35052 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC1P35052 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC1P35052 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC1P35052 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC1P35052 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC1P35052 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC1P35052 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC1P35052 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC1P35052 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC1P35052 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC1P35052 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC1P35052 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC1P35052 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC1P35052 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC1P35052 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC1P35052 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC1P35052 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC1P35052 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC1P35052 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC1P35052 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC1P35052 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC1P35052 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC1P35052 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC1P35052 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC1P35052 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC1P35052 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC1P35052 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC1P35052 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC1P35052 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC1P35052 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC1P35052 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC1P35052 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC1P35052 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC1P35052 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC1P35052 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC1P35052 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC1P35052 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC1P35052 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC1P35052 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPC1P35052 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC1P35052 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC1P35052 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC1P35052 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC1P35052 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC1P35052 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC1P35052 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC1P35052 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC1P35052 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC1P35052 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC1P35052 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC1P35052 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC1P35052 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC1P35052 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC1P35052 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC1P35052 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC1P35052 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC1P35052 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC1P35052 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC1P35052 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC1P35052 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC1P35052 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC1P35052 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC1P35052 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC1P35052 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPC1P35052 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC1P35052 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC1P35052 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC1P35052 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC1P35052 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC1P35052 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC1P35052 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC1P35052 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC1P35052 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC1P35052 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC1P35052 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC1P35052 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC1P35052 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC1P35052 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC1P35052 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC1P35052 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC1P35052 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC1P35052 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC1P35052 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC1P35052 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC1P35052 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC1P35052 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC1P35052 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC1P35052 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC1P35052 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC1P35052 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC1P35052 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC1P35052 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC1P35052 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC1P35052 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC1P35052 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC1P35052 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC1P35052 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC1P35052 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms