Protein–RNA interactions for Protein: P30926

CHRNB4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB4P30926 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB4P30926 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNB4P30926 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHRNB4P30926 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNB4P30926 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNB4P30926 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNB4P30926 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNB4P30926 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB4P30926 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB4P30926 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB4P30926 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB4P30926 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB4P30926 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB4P30926 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB4P30926 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB4P30926 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB4P30926 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB4P30926 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB4P30926 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB4P30926 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms