Protein–RNA interactions for Protein: P27482

CALML3, Calmodulin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML3P27482 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CALML3P27482 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CALML3P27482 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CALML3P27482 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALML3P27482 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALML3P27482 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALML3P27482 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALML3P27482 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALML3P27482 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALML3P27482 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALML3P27482 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CALML3P27482 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CALML3P27482 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CALML3P27482 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CALML3P27482 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CALML3P27482 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CALML3P27482 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CALML3P27482 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CALML3P27482 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CALML3P27482 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CALML3P27482 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CALML3P27482 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CALML3P27482 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CALML3P27482 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CALML3P27482 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CALML3P27482 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CALML3P27482 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CALML3P27482 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CALML3P27482 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CALML3P27482 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CALML3P27482 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CALML3P27482 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CALML3P27482 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CALML3P27482 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CALML3P27482 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CALML3P27482 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CALML3P27482 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CALML3P27482 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CALML3P27482 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CALML3P27482 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CALML3P27482 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CALML3P27482 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CALML3P27482 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CALML3P27482 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CALML3P27482 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CALML3P27482 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CALML3P27482 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CALML3P27482 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CALML3P27482 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALML3P27482 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALML3P27482 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALML3P27482 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALML3P27482 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALML3P27482 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CALML3P27482 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CALML3P27482 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CALML3P27482 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CALML3P27482 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CALML3P27482 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CALML3P27482 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CALML3P27482 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CALML3P27482 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CALML3P27482 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CALML3P27482 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CALML3P27482 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CALML3P27482 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CALML3P27482 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CALML3P27482 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CALML3P27482 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALML3P27482 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALML3P27482 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALML3P27482 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALML3P27482 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALML3P27482 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALML3P27482 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALML3P27482 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALML3P27482 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CALML3P27482 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CALML3P27482 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALML3P27482 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALML3P27482 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALML3P27482 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALML3P27482 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALML3P27482 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CALML3P27482 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CALML3P27482 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CALML3P27482 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CALML3P27482 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALML3P27482 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CALML3P27482 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALML3P27482 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CALML3P27482 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CALML3P27482 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALML3P27482 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALML3P27482 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALML3P27482 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALML3P27482 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALML3P27482 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CALML3P27482 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CALML3P27482 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms