Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFX1P22670 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RFX1P22670 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFX1P22670 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFX1P22670 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFX1P22670 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFX1P22670 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFX1P22670 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFX1P22670 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFX1P22670 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFX1P22670 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFX1P22670 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFX1P22670 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RFX1P22670 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RFX1P22670 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RFX1P22670 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFX1P22670 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFX1P22670 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFX1P22670 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFX1P22670 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFX1P22670 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFX1P22670 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFX1P22670 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFX1P22670 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX1P22670 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX1P22670 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX1P22670 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFX1P22670 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFX1P22670 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFX1P22670 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFX1P22670 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFX1P22670 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFX1P22670 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFX1P22670 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFX1P22670 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFX1P22670 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFX1P22670 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFX1P22670 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFX1P22670 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RFX1P22670 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFX1P22670 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFX1P22670 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFX1P22670 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFX1P22670 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFX1P22670 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFX1P22670 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFX1P22670 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFX1P22670 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFX1P22670 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFX1P22670 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFX1P22670 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX1P22670 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX1P22670 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX1P22670 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFX1P22670 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFX1P22670 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFX1P22670 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFX1P22670 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFX1P22670 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX1P22670 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX1P22670 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX1P22670 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX1P22670 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX1P22670 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX1P22670 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX1P22670 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFX1P22670 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFX1P22670 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFX1P22670 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFX1P22670 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFX1P22670 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX1P22670 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX1P22670 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX1P22670 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX1P22670 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX1P22670 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX1P22670 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX1P22670 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX1P22670 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RFX1P22670 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFX1P22670 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RFX1P22670 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFX1P22670 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RFX1P22670 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFX1P22670 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX1P22670 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX1P22670 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX1P22670 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX1P22670 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX1P22670 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX1P22670 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX1P22670 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX1P22670 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX1P22670 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX1P22670 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX1P22670 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX1P22670 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX1P22670 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX1P22670 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX1P22670 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms