Protein–RNA interactions for Protein: P22223

CDH3, Cadherin-3, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH3P22223 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH3P22223 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH3P22223 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH3P22223 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH3P22223 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH3P22223 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH3P22223 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH3P22223 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH3P22223 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH3P22223 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH3P22223 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH3P22223 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH3P22223 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH3P22223 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH3P22223 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH3P22223 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH3P22223 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH3P22223 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH3P22223 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH3P22223 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH3P22223 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH3P22223 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH3P22223 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH3P22223 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH3P22223 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH3P22223 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH3P22223 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH3P22223 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH3P22223 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH3P22223 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH3P22223 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH3P22223 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH3P22223 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDH3P22223 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH3P22223 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH3P22223 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH3P22223 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH3P22223 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH3P22223 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH3P22223 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH3P22223 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH3P22223 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH3P22223 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH3P22223 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH3P22223 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH3P22223 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH3P22223 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH3P22223 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH3P22223 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH3P22223 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH3P22223 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH3P22223 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH3P22223 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH3P22223 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH3P22223 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH3P22223 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH3P22223 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH3P22223 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH3P22223 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH3P22223 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH3P22223 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH3P22223 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH3P22223 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH3P22223 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH3P22223 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH3P22223 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH3P22223 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH3P22223 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH3P22223 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH3P22223 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH3P22223 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH3P22223 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH3P22223 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH3P22223 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH3P22223 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH3P22223 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH3P22223 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH3P22223 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH3P22223 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH3P22223 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH3P22223 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH3P22223 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH3P22223 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH3P22223 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH3P22223 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH3P22223 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH3P22223 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH3P22223 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH3P22223 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH3P22223 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH3P22223 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH3P22223 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH3P22223 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH3P22223 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH3P22223 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDH3P22223 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH3P22223 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH3P22223 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH3P22223 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH3P22223 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms