Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB5AP20339 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB5AP20339 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms