Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM21P19474 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM21P19474 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM21P19474 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms