Protein–RNA interactions for Protein: P17081

RHOQ, Rho-related GTP-binding protein RhoQ, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOQP17081 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOQP17081 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOQP17081 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOQP17081 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOQP17081 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOQP17081 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOQP17081 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOQP17081 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOQP17081 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHOQP17081 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHOQP17081 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHOQP17081 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHOQP17081 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOQP17081 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOQP17081 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOQP17081 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOQP17081 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOQP17081 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOQP17081 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOQP17081 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOQP17081 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOQP17081 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOQP17081 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOQP17081 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOQP17081 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOQP17081 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOQP17081 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOQP17081 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOQP17081 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOQP17081 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOQP17081 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOQP17081 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOQP17081 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOQP17081 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOQP17081 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOQP17081 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOQP17081 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOQP17081 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOQP17081 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOQP17081 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOQP17081 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOQP17081 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOQP17081 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOQP17081 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOQP17081 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOQP17081 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOQP17081 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOQP17081 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOQP17081 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOQP17081 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOQP17081 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOQP17081 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOQP17081 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOQP17081 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOQP17081 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOQP17081 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOQP17081 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOQP17081 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOQP17081 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOQP17081 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOQP17081 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOQP17081 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOQP17081 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOQP17081 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOQP17081 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOQP17081 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOQP17081 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOQP17081 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOQP17081 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOQP17081 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOQP17081 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOQP17081 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOQP17081 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOQP17081 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOQP17081 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOQP17081 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOQP17081 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOQP17081 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOQP17081 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOQP17081 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOQP17081 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOQP17081 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOQP17081 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOQP17081 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOQP17081 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOQP17081 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOQP17081 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOQP17081 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOQP17081 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOQP17081 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOQP17081 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOQP17081 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOQP17081 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOQP17081 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOQP17081 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOQP17081 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOQP17081 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOQP17081 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOQP17081 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOQP17081 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms