Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CKBP12277 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CKBP12277 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CKBP12277 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CKBP12277 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CKBP12277 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CKBP12277 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CKBP12277 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CKBP12277 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CKBP12277 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CKBP12277 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CKBP12277 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CKBP12277 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CKBP12277 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CKBP12277 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CKBP12277 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CKBP12277 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CKBP12277 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CKBP12277 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CKBP12277 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CKBP12277 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CKBP12277 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CKBP12277 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CKBP12277 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CKBP12277 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CKBP12277 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CKBP12277 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CKBP12277 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CKBP12277 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CKBP12277 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CKBP12277 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CKBP12277 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CKBP12277 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CKBP12277 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CKBP12277 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CKBP12277 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CKBP12277 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CKBP12277 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CKBP12277 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CKBP12277 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CKBP12277 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CKBP12277 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CKBP12277 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CKBP12277 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CKBP12277 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CKBP12277 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CKBP12277 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CKBP12277 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CKBP12277 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CKBP12277 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CKBP12277 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CKBP12277 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CKBP12277 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CKBP12277 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CKBP12277 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CKBP12277 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CKBP12277 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CKBP12277 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CKBP12277 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CKBP12277 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CKBP12277 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CKBP12277 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CKBP12277 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CKBP12277 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CKBP12277 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CKBP12277 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CKBP12277 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CKBP12277 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CKBP12277 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CKBP12277 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CKBP12277 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CKBP12277 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CKBP12277 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CKBP12277 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CKBP12277 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CKBP12277 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CKBP12277 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CKBP12277 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CKBP12277 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CKBP12277 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKBP12277 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKBP12277 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKBP12277 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKBP12277 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CKBP12277 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKBP12277 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CKBP12277 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKBP12277 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CKBP12277 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CKBP12277 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CKBP12277 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CKBP12277 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CKBP12277 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CKBP12277 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CKBP12277 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CKBP12277 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CKBP12277 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CKBP12277 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CKBP12277 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CKBP12277 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms