Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf89P0DMQ9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C8orf89P0DMQ9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf89P0DMQ9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf89P0DMQ9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms