Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00032P0C843 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00032P0C843 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00032P0C843 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00032P0C843 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.1 ms