Protein–RNA interactions for Protein: P0C672

TSPAN19, Putative tetraspanin-19, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN19P0C672 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN19P0C672 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN19P0C672 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN19P0C672 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN19P0C672 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN19P0C672 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN19P0C672 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN19P0C672 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN19P0C672 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN19P0C672 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN19P0C672 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSPAN19P0C672 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSPAN19P0C672 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN19P0C672 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN19P0C672 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN19P0C672 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN19P0C672 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN19P0C672 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN19P0C672 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN19P0C672 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN19P0C672 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN19P0C672 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN19P0C672 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN19P0C672 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN19P0C672 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN19P0C672 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN19P0C672 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN19P0C672 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms