Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLTAP09496 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CLTAP09496 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLTAP09496 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTAP09496 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTAP09496 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLTAP09496 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CLTAP09496 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLTAP09496 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLTAP09496 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLTAP09496 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLTAP09496 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLTAP09496 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTAP09496 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTAP09496 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTAP09496 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTAP09496 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLTAP09496 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLTAP09496 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CLTAP09496 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLTAP09496 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLTAP09496 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLTAP09496 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLTAP09496 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLTAP09496 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLTAP09496 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLTAP09496 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTAP09496 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTAP09496 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTAP09496 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLTAP09496 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTAP09496 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTAP09496 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTAP09496 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTAP09496 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTAP09496 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTAP09496 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLTAP09496 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLTAP09496 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLTAP09496 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLTAP09496 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLTAP09496 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLTAP09496 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLTAP09496 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLTAP09496 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLTAP09496 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLTAP09496 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLTAP09496 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CLTAP09496 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CLTAP09496 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLTAP09496 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLTAP09496 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTAP09496 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTAP09496 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTAP09496 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTAP09496 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLTAP09496 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLTAP09496 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLTAP09496 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTAP09496 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTAP09496 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTAP09496 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTAP09496 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTAP09496 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTAP09496 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTAP09496 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTAP09496 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTAP09496 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTAP09496 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTAP09496 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTAP09496 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLTAP09496 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLTAP09496 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLTAP09496 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLTAP09496 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTAP09496 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTAP09496 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTAP09496 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTAP09496 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTAP09496 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTAP09496 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTAP09496 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTAP09496 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTAP09496 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTAP09496 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTAP09496 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTAP09496 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTAP09496 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTAP09496 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTAP09496 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTAP09496 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CLTAP09496 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CLTAP09496 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLTAP09496 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLTAP09496 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLTAP09496 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLTAP09496 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CLTAP09496 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLTAP09496 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLTAP09496 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms