Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYL1P05976 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYL1P05976 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYL1P05976 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MYL1P05976 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYL1P05976 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYL1P05976 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYL1P05976 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYL1P05976 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYL1P05976 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYL1P05976 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYL1P05976 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYL1P05976 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYL1P05976 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYL1P05976 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MYL1P05976 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MYL1P05976 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MYL1P05976 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MYL1P05976 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MYL1P05976 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYL1P05976 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYL1P05976 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYL1P05976 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYL1P05976 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYL1P05976 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYL1P05976 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYL1P05976 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYL1P05976 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYL1P05976 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYL1P05976 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYL1P05976 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYL1P05976 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYL1P05976 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYL1P05976 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYL1P05976 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYL1P05976 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYL1P05976 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYL1P05976 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYL1P05976 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYL1P05976 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYL1P05976 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MYL1P05976 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYL1P05976 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYL1P05976 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYL1P05976 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYL1P05976 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYL1P05976 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MYL1P05976 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYL1P05976 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYL1P05976 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYL1P05976 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYL1P05976 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYL1P05976 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYL1P05976 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYL1P05976 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYL1P05976 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYL1P05976 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYL1P05976 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYL1P05976 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MYL1P05976 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYL1P05976 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYL1P05976 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYL1P05976 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYL1P05976 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MYL1P05976 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYL1P05976 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYL1P05976 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MYL1P05976 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MYL1P05976 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MYL1P05976 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYL1P05976 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYL1P05976 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYL1P05976 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYL1P05976 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYL1P05976 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYL1P05976 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYL1P05976 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYL1P05976 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYL1P05976 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYL1P05976 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYL1P05976 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYL1P05976 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYL1P05976 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYL1P05976 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYL1P05976 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYL1P05976 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYL1P05976 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYL1P05976 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYL1P05976 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYL1P05976 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYL1P05976 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYL1P05976 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYL1P05976 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYL1P05976 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYL1P05976 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYL1P05976 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYL1P05976 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYL1P05976 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYL1P05976 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYL1P05976 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 254 ms