Protein–RNA interactions for Protein: P04000

OPN1LW, Long-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1LWP04000 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OPN1LWP04000 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPN1LWP04000 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPN1LWP04000 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms