Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A1P02730 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A1P02730 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A1P02730 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A1P02730 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A1P02730 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A1P02730 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A1P02730 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A1P02730 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A1P02730 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A1P02730 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A1P02730 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A1P02730 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A1P02730 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A1P02730 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A1P02730 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
SLC4A1P02730 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms