Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF40O75150 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF40O75150 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF40O75150 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF40O75150 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF40O75150 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF40O75150 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF40O75150 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF40O75150 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF40O75150 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF40O75150 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF40O75150 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF40O75150 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF40O75150 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF40O75150 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF40O75150 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF40O75150 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF40O75150 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF40O75150 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF40O75150 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF40O75150 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF40O75150 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF40O75150 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF40O75150 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF40O75150 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF40O75150 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF40O75150 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF40O75150 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF40O75150 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF40O75150 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF40O75150 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF40O75150 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF40O75150 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF40O75150 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF40O75150 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF40O75150 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF40O75150 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF40O75150 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF40O75150 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF40O75150 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF40O75150 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF40O75150 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF40O75150 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF40O75150 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF40O75150 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF40O75150 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF40O75150 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF40O75150 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF40O75150 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF40O75150 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF40O75150 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF40O75150 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF40O75150 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF40O75150 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF40O75150 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF40O75150 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF40O75150 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF40O75150 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF40O75150 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF40O75150 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF40O75150 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF40O75150 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF40O75150 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF40O75150 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF40O75150 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF40O75150 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF40O75150 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF40O75150 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF40O75150 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF40O75150 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF40O75150 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF40O75150 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF40O75150 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF40O75150 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF40O75150 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF40O75150 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF40O75150 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF40O75150 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF40O75150 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF40O75150 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF40O75150 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RNF40O75150 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF40O75150 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF40O75150 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF40O75150 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF40O75150 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF40O75150 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF40O75150 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF40O75150 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF40O75150 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF40O75150 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF40O75150 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF40O75150 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF40O75150 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF40O75150 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF40O75150 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF40O75150 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF40O75150 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF40O75150 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF40O75150 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms