Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LANCL1O43813 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LANCL1O43813 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LANCL1O43813 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms