Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSI1O43347 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSI1O43347 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSI1O43347 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MSI1O43347 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MSI1O43347 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MSI1O43347 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSI1O43347 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSI1O43347 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSI1O43347 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MSI1O43347 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSI1O43347 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MSI1O43347 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MSI1O43347 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MSI1O43347 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MSI1O43347 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MSI1O43347 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MSI1O43347 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MSI1O43347 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MSI1O43347 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSI1O43347 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSI1O43347 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSI1O43347 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSI1O43347 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSI1O43347 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MSI1O43347 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSI1O43347 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSI1O43347 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSI1O43347 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSI1O43347 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSI1O43347 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSI1O43347 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSI1O43347 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSI1O43347 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MSI1O43347 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MSI1O43347 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MSI1O43347 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSI1O43347 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSI1O43347 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MSI1O43347 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSI1O43347 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSI1O43347 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSI1O43347 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSI1O43347 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSI1O43347 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSI1O43347 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSI1O43347 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSI1O43347 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSI1O43347 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSI1O43347 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSI1O43347 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSI1O43347 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSI1O43347 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSI1O43347 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSI1O43347 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSI1O43347 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSI1O43347 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSI1O43347 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSI1O43347 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSI1O43347 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSI1O43347 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
MSI1O43347 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSI1O43347 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSI1O43347 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSI1O43347 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSI1O43347 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSI1O43347 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSI1O43347 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSI1O43347 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSI1O43347 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MSI1O43347 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSI1O43347 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSI1O43347 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MSI1O43347 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSI1O43347 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSI1O43347 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSI1O43347 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSI1O43347 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSI1O43347 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSI1O43347 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSI1O43347 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSI1O43347 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MSI1O43347 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MSI1O43347 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MSI1O43347 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MSI1O43347 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSI1O43347 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSI1O43347 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSI1O43347 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSI1O43347 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MSI1O43347 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSI1O43347 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSI1O43347 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSI1O43347 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSI1O43347 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSI1O43347 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSI1O43347 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSI1O43347 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSI1O43347 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSI1O43347 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.3 ms