Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIAH2O43255 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIAH2O43255 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIAH2O43255 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SIAH2O43255 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms