Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLDN3O15551 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLDN3O15551 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLDN3O15551 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLDN3O15551 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLDN3O15551 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLDN3O15551 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLDN3O15551 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLDN3O15551 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLDN3O15551 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLDN3O15551 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLDN3O15551 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLDN3O15551 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLDN3O15551 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLDN3O15551 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLDN3O15551 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLDN3O15551 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CLDN3O15551 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLDN3O15551 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLDN3O15551 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLDN3O15551 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLDN3O15551 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLDN3O15551 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLDN3O15551 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLDN3O15551 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLDN3O15551 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLDN3O15551 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLDN3O15551 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLDN3O15551 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLDN3O15551 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLDN3O15551 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN3O15551 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN3O15551 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLDN3O15551 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLDN3O15551 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLDN3O15551 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLDN3O15551 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLDN3O15551 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CLDN3O15551 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLDN3O15551 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms