Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VILLO15195 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VILLO15195 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VILLO15195 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VILLO15195 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VILLO15195 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VILLO15195 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VILLO15195 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VILLO15195 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VILLO15195 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VILLO15195 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VILLO15195 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VILLO15195 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VILLO15195 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VILLO15195 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VILLO15195 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VILLO15195 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VILLO15195 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VILLO15195 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VILLO15195 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VILLO15195 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VILLO15195 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VILLO15195 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VILLO15195 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VILLO15195 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VILLO15195 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VILLO15195 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VILLO15195 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VILLO15195 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VILLO15195 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VILLO15195 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VILLO15195 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VILLO15195 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VILLO15195 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VILLO15195 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VILLO15195 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VILLO15195 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VILLO15195 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VILLO15195 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VILLO15195 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VILLO15195 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VILLO15195 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VILLO15195 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VILLO15195 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VILLO15195 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VILLO15195 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VILLO15195 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VILLO15195 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VILLO15195 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VILLO15195 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VILLO15195 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VILLO15195 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VILLO15195 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VILLO15195 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VILLO15195 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VILLO15195 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VILLO15195 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VILLO15195 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VILLO15195 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VILLO15195 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VILLO15195 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VILLO15195 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VILLO15195 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VILLO15195 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VILLO15195 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VILLO15195 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VILLO15195 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VILLO15195 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VILLO15195 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VILLO15195 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VILLO15195 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VILLO15195 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VILLO15195 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VILLO15195 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VILLO15195 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VILLO15195 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VILLO15195 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VILLO15195 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VILLO15195 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VILLO15195 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VILLO15195 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VILLO15195 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VILLO15195 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VILLO15195 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VILLO15195 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VILLO15195 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VILLO15195 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VILLO15195 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VILLO15195 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VILLO15195 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VILLO15195 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VILLO15195 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VILLO15195 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VILLO15195 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VILLO15195 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VILLO15195 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VILLO15195 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VILLO15195 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VILLO15195 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VILLO15195 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms