Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR1CO15160 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1CO15160 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms