Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MEIS1O00470 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEIS1O00470 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEIS1O00470 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEIS1O00470 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEIS1O00470 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEIS1O00470 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MEIS1O00470 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MEIS1O00470 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MEIS1O00470 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MEIS1O00470 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MEIS1O00470 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MEIS1O00470 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MEIS1O00470 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MEIS1O00470 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MEIS1O00470 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEIS1O00470 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEIS1O00470 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEIS1O00470 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEIS1O00470 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEIS1O00470 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MEIS1O00470 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEIS1O00470 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEIS1O00470 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEIS1O00470 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEIS1O00470 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MEIS1O00470 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MEIS1O00470 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MEIS1O00470 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MEIS1O00470 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEIS1O00470 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEIS1O00470 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MEIS1O00470 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MEIS1O00470 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MEIS1O00470 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MEIS1O00470 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MEIS1O00470 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MEIS1O00470 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MEIS1O00470 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MEIS1O00470 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
MEIS1O00470 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MEIS1O00470 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MEIS1O00470 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MEIS1O00470 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MEIS1O00470 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEIS1O00470 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEIS1O00470 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEIS1O00470 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEIS1O00470 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEIS1O00470 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MEIS1O00470 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MEIS1O00470 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MEIS1O00470 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MEIS1O00470 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MEIS1O00470 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEIS1O00470 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEIS1O00470 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEIS1O00470 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEIS1O00470 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEIS1O00470 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
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