Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms