Protein–RNA interactions for Protein: K7EJ46

SMIM22, Small integral membrane protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM22K7EJ46 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMIM22K7EJ46 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMIM22K7EJ46 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMIM22K7EJ46 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMIM22K7EJ46 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMIM22K7EJ46 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMIM22K7EJ46 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMIM22K7EJ46 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMIM22K7EJ46 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SMIM22K7EJ46 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SMIM22K7EJ46 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMIM22K7EJ46 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMIM22K7EJ46 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMIM22K7EJ46 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMIM22K7EJ46 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMIM22K7EJ46 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMIM22K7EJ46 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SMIM22K7EJ46 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMIM22K7EJ46 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMIM22K7EJ46 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMIM22K7EJ46 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMIM22K7EJ46 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMIM22K7EJ46 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMIM22K7EJ46 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMIM22K7EJ46 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMIM22K7EJ46 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMIM22K7EJ46 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMIM22K7EJ46 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMIM22K7EJ46 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMIM22K7EJ46 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMIM22K7EJ46 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMIM22K7EJ46 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMIM22K7EJ46 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SMIM22K7EJ46 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMIM22K7EJ46 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMIM22K7EJ46 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMIM22K7EJ46 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SMIM22K7EJ46 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMIM22K7EJ46 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMIM22K7EJ46 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMIM22K7EJ46 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMIM22K7EJ46 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMIM22K7EJ46 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMIM22K7EJ46 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SMIM22K7EJ46 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms