Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms