Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C9orf172C9J069 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C9orf172C9J069 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf172C9J069 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf172C9J069 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms