Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
B4E1Z4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
B4E1Z4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
B4E1Z4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
B4E1Z4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
B4E1Z4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
B4E1Z4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
B4E1Z4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4E1Z4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4E1Z4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4E1Z4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4E1Z4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4E1Z4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4E1Z4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4E1Z4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4E1Z4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
B4E1Z4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
B4E1Z4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
B4E1Z4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
B4E1Z4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
B4E1Z4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
B4E1Z4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
B4E1Z4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
B4E1Z4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
B4E1Z4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
B4E1Z4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
B4E1Z4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
B4E1Z4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
B4E1Z4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
B4E1Z4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
B4E1Z4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
B4E1Z4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
B4E1Z4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
B4E1Z4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
B4E1Z4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
B4E1Z4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
B4E1Z4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
B4E1Z4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
B4E1Z4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
B4E1Z4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
B4E1Z4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
B4E1Z4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
B4E1Z4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
B4E1Z4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
B4E1Z4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
B4E1Z4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
B4E1Z4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
B4E1Z4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
B4E1Z4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4E1Z4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4E1Z4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4E1Z4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4E1Z4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4E1Z4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
B4E1Z4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
B4E1Z4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
B4E1Z4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
B4E1Z4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
B4E1Z4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
B4E1Z4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
B4E1Z4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
B4E1Z4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
B4E1Z4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
B4E1Z4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
B4E1Z4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
B4E1Z4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
B4E1Z4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
B4E1Z4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
B4E1Z4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
B4E1Z4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
B4E1Z4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
B4E1Z4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
B4E1Z4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
B4E1Z4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
B4E1Z4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
B4E1Z4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
B4E1Z4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
B4E1Z4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
B4E1Z4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
B4E1Z4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
B4E1Z4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
B4E1Z4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
B4E1Z4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
B4E1Z4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
B4E1Z4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
B4E1Z4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
B4E1Z4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
B4E1Z4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
B4E1Z4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
B4E1Z4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
B4E1Z4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
B4E1Z4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
B4E1Z4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
B4E1Z4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
B4E1Z4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
B4E1Z4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
B4E1Z4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
B4E1Z4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
B4E1Z4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
B4E1Z4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms