Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRN3P2A6NIE6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRN3P2A6NIE6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRN3P2A6NIE6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RRN3P2A6NIE6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRN3P2A6NIE6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRN3P2A6NIE6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRN3P2A6NIE6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRN3P2A6NIE6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRN3P2A6NIE6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRN3P2A6NIE6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRN3P2A6NIE6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRN3P2A6NIE6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RRN3P2A6NIE6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRN3P2A6NIE6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RRN3P2A6NIE6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRN3P2A6NIE6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRN3P2A6NIE6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRN3P2A6NIE6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRN3P2A6NIE6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRN3P2A6NIE6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRN3P2A6NIE6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRN3P2A6NIE6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRN3P2A6NIE6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRN3P2A6NIE6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRN3P2A6NIE6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RRN3P2A6NIE6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRN3P2A6NIE6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRN3P2A6NIE6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRN3P2A6NIE6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RRN3P2A6NIE6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRN3P2A6NIE6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRN3P2A6NIE6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRN3P2A6NIE6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRN3P2A6NIE6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRN3P2A6NIE6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRN3P2A6NIE6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms