Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TCAF2A6NFQ2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCAF2A6NFQ2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCAF2A6NFQ2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TCAF2A6NFQ2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCAF2A6NFQ2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCAF2A6NFQ2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCAF2A6NFQ2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TCAF2A6NFQ2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCAF2A6NFQ2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TCAF2A6NFQ2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCAF2A6NFQ2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCAF2A6NFQ2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCAF2A6NFQ2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TCAF2A6NFQ2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCAF2A6NFQ2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCAF2A6NFQ2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms