Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRAMEF22A3QJZ6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PRAMEF22A3QJZ6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRAMEF22A3QJZ6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRAMEF22A3QJZ6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRAMEF22A3QJZ6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRAMEF22A3QJZ6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRAMEF22A3QJZ6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
PRAMEF22A3QJZ6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRAMEF22A3QJZ6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRAMEF22A3QJZ6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRAMEF22A3QJZ6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRAMEF22A3QJZ6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
PRAMEF22A3QJZ6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRAMEF22A3QJZ6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
PRAMEF22A3QJZ6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRAMEF22A3QJZ6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRAMEF22A3QJZ6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRAMEF22A3QJZ6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PRAMEF22A3QJZ6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRAMEF22A3QJZ6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRAMEF22A3QJZ6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRAMEF22A3QJZ6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
PRAMEF22A3QJZ6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRAMEF22A3QJZ6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRAMEF22A3QJZ6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRAMEF22A3QJZ6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms