Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms