Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms