Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms