Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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