Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms