Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFDP1Q9UEE9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms