Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARGC1AQ9UBK2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGC1AQ9UBK2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms