Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms